ネットショップのカート別・決済手数料を比較【2026年版】月額込みの実質コストで見る

ネットショップのカート別・決済手数料を比較【2026年版】月額込みの実質コストで見る

ネットショップのカートを選ぶとき、月額料金に目が行きがちです。
ただ、売上が増えるほど、効いてくるのは売上ごとに引かれる「決済手数料」のほうです。

この記事では、主要なカートの公式料金ページ(2026年10月21日に確認)をもとに、クレジットカードの決済手数料を比較します。
あわせて、月商100万円の場合の「月額込みの実質コスト」も試算しました。

先に結論:カードの手数料は3%台が中心。ただし、かかり方は大きく違う

  • クレジットカードの決済手数料は、主要なカートで3.2〜3.6%前後が中心です
  • BASEのスタンダードだけは、決済手数料のほかに「サービス利用料3%」がかかります。月商100万円(カード決済のみ)だと、手数料の合計は売上の約7%になります
  • 月額が安いカートは、売上が小さいうちは有利です。売上が増えると、料率の低いプランのほうが得になります
  • 入金サイクルも、カートによって違います。BASEは申請から10営業日、STORES・カラーミーショップ・MakeShopは月末締めの翌月末が基本です
  • futureshopは、公式ページに決済手数料の料率が載っていません。決済手段ごとに手数料がかかると案内されています

カート別・クレジットカード決済手数料の比較表

カートプラン月額カード決済手数料気をつけたい点
ShopifyBasic3,650円(年払い)3.55%外部の決済サービスを使うと、別途取引手数料がかかる(Basic 2%、Grow 1%、Advanced 0.6%)
Grow10,100円(年払い)3.4%
Advanced44,000円(年払い)3.25%
BASEスタンダード0円3.6%+40円サービス利用料が3%別にかかる
グロース16,580円(年払い)
19,980円(月払い)
2.9%サービス利用料は0円
STORESフリー0円5.5%〜振込手数料275円がかかる
スタンダード3,300円(年契約)
3,960円(月契約)
3.6%〜
カラーミーショップレギュラー4,950円3.4%〜「カラーミーペイメント」を契約した場合の料率
ラージ9,595円3.19%〜
プレミアム35,640円〜2.99%〜
MakeShopプレミアム13,750円
(+カード決済の月額1,650円)
3.19%ブランド別の月間決済額が50万円以上の場合の料率。エンタープライズは3.14%
futureshopfutureshop 50〜27,000円〜(税抜)公式ページに記載なしカード決済のオプション(SBPS)は月額1,500円。決済手段ごとに別途手数料あり
EC-CUBE——契約する決済代行会社によるカート自体に決済手数料はなく、決済代行会社と別に契約する

金額は、各サービスの公式ページの表記のままです。税込・税抜の表記は、サービスによって異なります。

PayPay・Amazon Pay・後払いなどの手数料

カード以外の決済手段は、カートによって扱いが大きく変わります。

  • カラーミーショップ:PayPayは月額2,200円+3.45%(プレミアムは3.45%)、楽天ペイは月額2,200円+4%、Amazon Payは3.9%、後払いは4.0%〜、コンビニ払いは165円〜、代金引換は396円〜(いずれもカラーミーペイメントの料率)
  • BASE:PayPay・Amazon Pay・PayPalは、決済手数料に1%が加算されます
  • STORES:PayPal、あと払い(ペイディ)、atone、楽天Pay、PayPay残高、Amazon Pay、キャリア決済は、スタンダードで4.6%、フリーで6.5%

PayPayやAmazon Payの位置づけと、どの決済手段を入れるかについては、次の記事で整理しています。

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月商100万円の場合の実質コストを試算する

決済手数料だけでなく、月額も足した「実質コスト」で比べてみます。

試算の条件:月商100万円、客単価8,000円(月125件)、すべてクレジットカード決済。他の決済手段、振込手数料、入金サイクルは含めていません。

カート・プラン月間コスト売上に対する割合
カラーミーショップ レギュラー38,950円3.90%
Shopify Basic(年払い)39,150円3.91%
STORES スタンダード(年契約)39,300円3.93%
カラーミーショップ ラージ41,495円4.15%
Shopify Grow(年払い)44,100円4.41%
BASE グロース(年払い)45,580円4.56%
MakeShop プレミアム47,300円4.73%
STORES フリー55,000円5.50%
BASE スタンダード71,000円7.10%

この条件では、カラーミーショップ(レギュラー)、Shopify(Basic)、STORES(スタンダード)が、3.9%前後で並びました。
MakeShopのプレミアムは、決済手数料の料率は低めですが、月額が高い分、この売上規模では実質コストが上がります。月商が大きくなるほど、差は縮まります。

BASEは、月商40万円前後でプランが逆転する

BASEは、スタンダードとグロースで、コストのかかり方が大きく変わります。

月商スタンダードグロース(年払い)
30万円21,300円25,280円
50万円35,500円31,080円
100万円71,000円45,580円

客単価8,000円の場合、月商が約40万円を超えると、グロースのほうが安くなります。

入金サイクルの比較

売上が入金されるまでの期間は、カートによって大きく違います。
月末締め・翌月末払いの場合、月初の売上が入金されるまでに、2か月近くかかります。仕入れや広告費の支払いが先に出ていくショップでは、資金繰りに響きます。

カート入金サイクル早く受け取る方法・補足
Shopify公式ページで確認できず(Shopify Paymentsの入金スケジュールは、管理画面とヘルプで確認)—
BASE申請から10営業日で入金「最速振込」を使うと、最短で当日に入金(土日祝も可)。最速振込の手数料は、公式の料金ページに記載なし
STORES月末締め(23:59まで)、翌月末払い最低振込金額は10,000円(手数料控除後)。振込手数料は275円
カラーミーショップ当月末日締め、翌月末日入金(すべての決済手段をまとめて入金)「早期入金サービス」(月額2,200円+0.5%)で、翌月15日入金に早められる
MakeShopクレジットカードは、月末締め、翌月末入金「即日売上入金オプション」(手数料1.5%、別途消費税)。カード以外の決済手段の入金サイクルは、確認できず
futureshop公式ページに記載なし(契約する決済代行会社による)—
EC-CUBE契約する決済代行会社による—

公式ページで確認できなかった項目は、「確認できず」「記載なし」としています。入金日は、決済手段や金融機関の休業日で変わることがあるため、契約前に最新の案内をご確認ください。

手数料以外に見ておきたいこと

  • 3Dセキュア:クレジットカード決済では、3Dセキュア2.0への対応が必要です。futureshopでは、EMV 3-Dセキュア(3Dセキュア2.0)が、無料のオプションとして用意されています
  • 決済代行会社を選べるか:EC-CUBEやfutureshopのように、決済代行会社と別に契約するカートでは、手数料の料率が契約で変わります。売上が大きくなったら、見直しや交渉の余地があります

カートはどう選ぶか

決済手数料の差は、売上が小さいうちは、月額の差に隠れます。売上が増えるほど、料率の差が効いてきます。
ただ、カートの選び方は、手数料だけでは決まりません。商品数、デザインの自由度、運用にかけられる手間によって、向いているカートは変わります。

まずは、自社の月商と客単価で、上の表と同じように試算してみてください。そのうえで、機能や運用面を、次の記事で比べるのがおすすめです。

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まとめ

カードの決済手数料は、主要なカートで3%台が中心です。ただ、BASEのように別のサービス利用料がかかるものや、月額が高いプランもあるので、売上規模に合わせて「月額込みの実質コスト」で比べるのがポイントです。

どのカートが合うか、現在の売上で試算してみたい場合は、お気軽にご相談ください。
ECサイトの制作から、カートの選定、決済手段の設計まで、一緒に進めます。

参考にした情報

以下の公式ページの情報を、2026年10月21日に確認しました(入金サイクルは10月23日に確認)。料金や条件は変更されることがあるため、導入前に最新の情報をご確認ください。

小田浩史のイメージ
株式会社SIBLAB 代表取締役
小田浩史
20年以上IT業界でホームページ制作、ECサイト制作、アクセス解析、Webマーケティングに従事。 特にアクセス解析、ユーザビリティテストについてはプロのWeb制作会社向けに講演した経験は多数。上級ウェブ解析士。 会社にも猫を連れ込むほど猫好き。 休日は猫と遊ぶか、ゲームするか、ぼーっとアクセス解析データを眺めて過ごしています。
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